兒童癲癇病起病越早預后越差。部分性發作預后以精神運動性發作較差，嬰兒痙攣預后#!差。癲癇病人平均壽命并不短，但若見某些已知的腦器質性病變如腦腫瘤、腦穿通畸形、腦萎縮等癥狀預后差。

癲癇病屬于可治性疾病，對癲癇病的預后估計與許多因素有關，如發作類型、病因、發作頻率、起病年齡、頭皮腦電圖表現以及對抗癲癇藥的反應等。經調查，癲癇病自然緩解5年以上占27.1%。典型失神發作：尤其在10歲前發病者預后#!好，緩解率可達80%。

發作頻率越高預后越差。正常或接近正常的頭皮腦電圖是預后良好證據，異常頭皮腦電圖中雙側同步放電預后較好，一側半球異常，或彌散性異常預后則較差，局限性異常預后差，尖慢綜合波，局限棘波等預后較差，頭皮腦電圖定位在頂、枕中央區預后較好。顳和額區預后較差，兒童中顳棘波表示預后好。

頭皮腦電圖和發作之間并不完全一致。頭皮腦電圖異常的臨床發作停止，不是預后的征象。

個別病例有猝死可能，查不到原因，推測可能與突然嚴重顱內壓增高、急性腎上腺功能不足或植物性神性功能癱瘓或腦干功能急性喪失引起呼吸或血循環障礙有關。隨著癲癇外科手術的開展，一些復雜部分癲癇及某些藥物無法控制的難治性癲癇，經過合適的處理，一部分病例明顯改善，不發作及很少發作者在30%～70%之間。

兒童癲癇病起病越早預后越差，1歲以前起病的，發作往往難以控制，預后差。晚發性癲癇，如無腦瘤等器質性損害，預后較好。發作在早期得到治療者預后較好，起病5年后開始治療的預后不良，發作能很快被單一常規劑量的抗癲癇藥物控制者預后較好。