如果癲癇發作無法用內科方法控制，應行外科手術治療。由于幼兒癲癇的發作頻率高，每天常在10~100次，所以很快就會用遍所有能控制嚴重兒童癲癇的藥物。

對于頑固性癲癇的評定建立于患者對藥物不良反應耐受的基礎上，當治療藥物濃度已給患者帶來嚴重的不良反應時，應考慮手術治療。手術治療癲癇無#!小年齡限制。一些發達國家對于嬰幼兒難治性癲癇治療強調早期手術，藥物治療1~2個月無效可考慮手術治療。近年來，我院形成了小兒癲癇的多學科診治團隊，包括小兒神經內科、小兒神經外科、影像學及腦電圖，開展了小兒癲癇外科治療，獲得較好療效。

癲癇手術也有禁忌證

兒童癲癇手術方法有顳葉切除術、選擇性海馬杏仁核切除術、半球切除術、胼胝體切斷術、多處軟腦膜下橫纖維切斷術、腦皮質癲癇灶切除術、迷走神經電刺激術治療頑固性癲癇等。

癲癇手術患者的選擇應符合以下基本原則：必須是藥物難治性癲癇;必須存在明確的致癇灶;手術必須不會引起嚴重功能障礙;對于存在腦結構性病變的患者，無須滿足難治性癲癇的標準，可手術者應盡早手術;對于年幼患兒，原則上應該早期手術，以盡早阻斷癲癇發作對大腦發育和功能的負面影響。

手術患者應排除以下手術禁忌證：一般而言具有自行緩解趨勢的良性癲癇綜合征、變性和代謝性疾病或其他內科疾病所致癲癇、原發性全身性癲癇、不影響生活的輕微癲癇發作、伴有活動性精神病或進行性神經疾病及嚴重的內科疾病是絕對手術禁忌證，智商<70屬于相對禁忌證。