CT是“電子計算機斷層掃描”的英文縮寫。它利用ⅹ線斷層掃描，把接收到的信號輸入到計算機，再由計算機轉化為圖像。進行腦CT檢查是把腦子分成若干層，每層拍出一張圖片，來反映腦子深部的情況。

CT有很多優點，是一種無痛苦、無損傷、無危險、快速方便的輔助檢查方法。假如腦子有結構上的異常，做CT檢查很容易被發現。腦腫瘤、腦畸形、腦出血、腦萎縮、腦積水、異常鈣化、腦水腫等都可從CT片子上顯示出來。頭顱CT不僅可以反映病變的部位和大小，還可以了解周圍腦組織的情況，協助判斷病變的性質。

近30多年來，由于應用了CT檢查，很多原來認為是“原發性”的癲癇找到了病因。不同類型的癲癇，CT的陽性率也不一樣，一般說來，部分性發作的癲癇陽性率較高，全身性發作的癲癇，陽性率較低。

雖然CT能發現大腦結構性的病變，但也有其局限性，如在顱腔內某些部位(如顱骨底部)的病變，由于骨質圖像的干擾不易顯出。又如很多疾病假如密度相似，也不容易區分，像炎癥、脫髓鞘病變或某些腫瘤在圖像上均表現為低密度，CT不容易將它們區別開來。另外，由于每層距離的限制，太小的病灶不易發現。

癲癇是一種發作性疾病，很多病人腦子并沒有結構上的改變，做CT檢查往往表現正常，因此CT正常并不能否定癲癇的診斷。CT的作用只是幫助尋找癲癇的病因。但也不能認為只要CT有異常，這異常就是癲癇的病因。還需要根據病情具體分析，有些異常發現和癲癇并沒有直接關系，如腦外積水、透明隔間隙增寬等。

磁共振(MRI)是通過體外高頻磁場和物體的相互作用來完成成像過程。它不含放射線，對人體無害，可完成腦部原子核分布的三維成像，同時拍攝出三個方面的圖形(矢狀面、水平面、冠狀面)。磁共振對腦腫瘤或其他結構異常圖形比CT更清晰，而且不受骨像干擾，對顱底和腦干部位的小病變也能顯示出來。有時CT不能顯示的等密度病灶，特別是對一些脫髓鞘性疾病，磁共振卻可以顯出。

磁共振檢查也有其局限性，它對顱內鈣化不能顯出。而且掃描時間較長，需數分鐘保持不動的姿勢，這對小兒來說配合起來較困難，往往需服用鎮靜劑才能完成。其檢查費用較CT更為昂貴。和CT一樣，磁共振對尋找癲癇的病因有幫助，但不能根據磁共振的正常與否來否定或肯定癲癇的診斷。