兒童癲癇病的治療與年齡息息相關，首先與年齡相關的藥代動力學。

新生兒期，兒童至青春期以及青春期，在青春期藥代動力學與成人相同。

新生兒及足月兒蛋白結合率低，卡馬西平、苯妥英及丙戊酸未結合部分升高，易于出現不良反應。在胎兒期母親服用抗癲癇藥的新生兒，其藥物清除率似成人;而在胎兒期未接受過抗癲癇藥者清除率慢。因缺氧導致肝腎損害者清除率更慢。足月兒生后6-8周肝腎功能才發育完成。

早產兒比足月兒代謝藥物的能力低，其N-去羥作用僅為成人的20%，至2歲才達到成人水平，細胞色素P450有與之相同的變化。生后數周或數月，藥清除率增加2-4倍，致使藥物濃度下降50%-70%，因新生兒及小嬰兒藥物代謝快吸收慢，所以藥物濃度應增加。

兒童與成人在藥代動力學方面有兩個不同。兒童期清除率高于成人，而且個體差異大，因此兒童需較大mG/KG劑量以保持適當的血濃度;兒童比成人有較大與體重比的表面積，而且代謝快。

兒童癲癇病的治療需要根據這個年齡段進行分析治療。